乳品加工技术研究中心是绿研院业务部门，面向国家需求和行业需要，负责乳制品的加工技术研究开发工作，完成国家和地方科技计划任务和行业技术支撑服务工作，有效实现解决共性关键技术并及时转化行业应用，从而产生国家亟需、企业认可的重大现实成果。立足行业发展需求，通过建立乳品技术科研平台和有利于技术创新、成果转化的机制，解决我国乳品加工企业共性关键技术问题，并在工程技术方面取得重大进展，加快科研成果向现实生产力转化，促进行业技术进步和核心竞争能力提高。

      “十二五期间”获黑龙江省科学技术发明一等奖1项，黑龙江省科技进步二等奖1项，黑龙江省自然科学二等奖1项等25个奖项。授权国内发明专利34项，授权实用新型专利7项；行业内推广乳及乳制品质量安全、婴幼儿配方乳粉研究及乳酸菌开发、新产品研发等方面40余项。其中：《乳基料及配料在婴幼儿配方乳粉中的应用》在伊利、飞鹤、圣元转化，累计新增年产值32亿元；《乳酸菌优良菌种及发酵剂产业化关键技术的开发应用》在完达山转化，实现新增年产值3.1亿元。

      “十三五”期间获省级一等奖2项，省级科技进步三等奖1项。授权发明专利92项，实用新型专利11项，发表论文300余篇，其中SCI和EI100余篇。国家重大研发计划《益生菌微生态健康调节机制与新型营养健康食品研发》具有通过研发新型新型营养健康食品，达到促进我国人民健康的重大现实意义。农业农村部《干乳制品加工技术集成科研基地建设项目》创制降膜浓缩蒸发器、离子交换色谱、奶酪拉伸机，购置多功能膜系统、冷冻干燥机，低温辅助喷雾干燥系统等一批大型设备和仪器18台（套）。形成紧密配合、分工协作、布局均衡的干乳制品加工集成科研基地体系，从整体上提升我国干乳制品加工领域的创新能力和水平，增强我国高附加值干乳制品加工的国际竞争力。与黑龙江飞鹤乳业有限公司、东北农业大学合作共同申报黑龙江省“百千万”工程科技重大专项——《中国母乳功能成分解析及牛乳基婴幼儿配方粉的研制及产业化》项目，为我国母乳数据库和检测方法的建立以及婴幼儿配方的优化奠定坚实的基础。